2009-2010 sezonunun devre arasında 24 yaşındayken Fenerbahçe'den Trabzonspor'a transfer olan Burak Yılmaz, kariyeri boyunca bir sezonda çift hanelere ulaşamamış bir kanat oyuncusuydu. Takımın başına devre arasında gelen Şenol Güneş yönetiminde de kanatlarda görev almaya devam eden Yılmaz, bordo mavili takımdaki yarım sezonunu 3 golle tamamlarken Şenol Güneş'in dokunuşu ertesi sezon etkisini göstermeye başladı.
2010-2011 sezonunda yine kanatlarda görev yapmasına rağmen ceza sahasına çok daha fazla giren ve yardımcı forvet rolüne soyunan Burak Yılmaz, sezonu 19 golle tamamlayarak kariyerindeki en golcü dönemi geçiriyordu.
2011-12 sezonunda Şenol Güneş tarafından santrfor olarak görevlendirilen Burak Yılmaz, kariyerinin zirvesine çıkarken 30 maçta 32 kez fileleri havalandırarak sezonu Süper Lig gol kralı olarak tamamlarken özellikle kısa süre içinde geliştirerek en güçlü yanları arasına soktuğu kafa vuruşlarıyla da dikkat çekiyordu. Milli Takımın da önemli bir parçası olan Burak Yılmaz, böylece Şenol Güneş'in teknik direktörlük kariyerinde çalıştırdığı takımlarda gol krallığına ulaşan 5 oyuncudan biri oluyordu.
Yetenekli ancak skora yeterince etki edemeyen bir kanat oyuncusuyken tanıştığı Şenol Güneş'in yönetiminde bir gol makinesine dönüşen Burak Yılmaz, şimdi kendisini kral haline getiren Şenol Güneş'le Beşiktaş'ta yeniden buluşuyor.
