Etkili çalımları ve ortalarıyla kısa sürede beğeni toplayan Emre, Türkiye Futbol Direktörü Fatih Terim'in de dikkatini çekerek Fransa'da düzenlenen 2016 Avrupa Futbol Şampiyonası'nda (EURO 2016) kadroya dahil oldu. Şampiyonada Hırvatistan ve Çek Cumhuriyeti karşılaşmalarında görev alan Emre, üstün performansıyla takımın önce çıkan oyuncuları arasında yer aldı ve sezon başında 9,75 milyon avro karşılığında Borussia Dortmund'un yolunu tuttu.